自从与玛戈、伊迪丝和阿格蕾丝三个可爱的小女孩实现宿命的邂逅，曾经的大坏蛋格鲁可真彻底转型了，他金盆洗手，转而化身为慈祥可亲的爸爸和做得一手烂口味布丁果冻的商人当然凡事没有尽善尽美的，在此期间，憧憬大坏蛋传奇人生的老搭档纳法利欧博士离他而去，另谋高就某天，格鲁被身怀绝技却鲁莽的特工露西·王尔德绑架，原来露西所在的集团研制出可以改变生物基因的药物，可他们位于南极的实验室被神秘窃贼偷走，因此才委托有过坏蛋经验的格鲁做卧底。经过一番考虑，格鲁接受了这项任务，带着超萌的小黄人们，和露西组成了爆笑连连的追凶搭档。